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检测报告解读
普通人能看懂**
检测的结果吗?
目前,国内各**
检测公司出具的**
检测报告有很多不同,有些公司出具的检测报告非人士可能看不懂。
与其他**
公司不同的是,中原谢赫**
自主研发了一套**
检测报告系统,每一个普通人在指导下拿到报告后都可以。
同时,中原谢赫**
检测将对每个人的**
检测报告进行详细解读,并提供疾DNA-疾DNA干预措施和健康管理服务。
如何解读肿瘤**
检测报告
我们以某**
检测公司的报告为例,通过对报告的解读来说明**
检测报告中所说的内容。
1.报告结构报告在结构上可以分为很多部分,首先是报告的基本信息,然后是用药提示。
通过用药提示,我们可以对整个报告的所有结果有一个了解,所有重要的结果都可以从用药提示中看到。
然后,用药提示分为两部分,一部分是靶向用药提示,另一部分是化疗用药提示。
那么接下来的部分就是变异检测结果,也就是说患者血液的DNA里面检测到的所有结果都在里面,如果有**
拷贝数变异,也在拷贝数变异检测结果里面。
下一页是现行NCCN指南荐的。
我们整理这些靶向和相应的**
检测结果,以便临床DNA看到结果。
但事实上,我们测试的比列出的要多得多。
然后是靶向的分析结果,分为很多部分。
首先,*个大表表示sensit
ive靶向,然后代表耐药和无效的靶向。
如果找到了耐药性的**
位点,就用这种形式写出来。
更后一部分是研究除此之外不一致的靶向。
一些文献支持**
突变对靶向敏感,而另一些则不然。
我们应该把这部分成果放在哪里?然后是化疗分析,一般有2-3页。
更后一部分是已报道的文献,即用于判断靶向敏感性和耐药性的引用文献,以及部分临床试验的清单。
更后,我们把我们测试的**
和测试中涉及的一些限制放在这里。
突变检测结果如下图所示。
我们可以看到这份报告的测试结果,一共是十二行。
每一行代表一个**
突变,
*行是**
的名字。
第二列是**
碱基变化和DNA变化,第三列是氨基酸变化,更后一列是突变频率。
因为正常细胞也会裂解和释放DNA,所以DNA不仅仅是肿瘤细胞的DNA,突变频率是指所有DNA测到的占该**
位点的肿瘤突变频率。
突变频率越高,肿瘤细胞所占百分比越大。
无花果。2在该患者的样本中,我们可以看到*行EGFR**
第19外显子的突变占51.9。
这种突变对靶向敏感,在这里仍然存在。
上,患者对特罗凯有耐药性。
为什么还存在?在第三行,我们可以看到T790M的存在,突变频率很高,为32.5。
引起*代和第二代抗性更常见的原因是T790M,约50是由该突变引起的。
好消息是,新批准的9291可以控制T790M突变引起的耐药性。
但这位患者也用了9291,但耐药进展。
往下看报告,可以看到EGFR**
的C7S。
该突变可导致T790M产生耐药性,突变频率为18.4,也很高。
从这些突变位点可以部分为什么目前患者对靶向不敏感。
此外,我们通过二代测序检测到其他耐药原因,即患者EGFR**
和HER2**
拷贝数扩增,难以从血液测到拷贝数扩增。
一般检测到**
的点突变。
同时,EGFR和HER2的扩增也可导致患者出现EGFR-TKI抵抗。
有了这么多不同的原因,比如T790M和C7S的突变、EGFR和HER2的扩增,我们就可以大致了解是什么导致了患者的耐药。
接下来,我们想知道有什么样的治疗方案。
无花果。3其它**
突变,如TP53突变频率也很高(36.7),第四纪RB1**
突变频率为20.5,也很高。
当然,也有突变频率较低的突变,但这些并没有显示在*页上。
这是因为这些**
虽然有突变,但目前还没有针对这些突变的靶向。
所以希望大家明白,虽然可以**
突变,但并不是所有的**
突变都有对应的
靶向,也就是说**
突变并不一定就会有相应的靶向,这是很重要的一点。
重复图2。
比如RB1**
是一个失活突变,该**
失活会导致对青霉素产生耐药性。
但是,由于帕西林不被FDA批准用于肺癌,我们没有将此纳入报告,但我们会在与患者沟通时这一结果。
我们可以看到ROS1和ALK**
也有突变,但虽然有突变,但这些突变并不处于非常重要的位置,不影响蛋白质的功能,也不适合用相应的靶向进行治疗。
一般来说,我们要先检测**
突变,再判断**
突变是否影响蛋白质功能。
只有当**
的功能确实受到影响、失活或持续时,靶向才能普遍起到一定的抑制作用,才能判断患者是否适合使用相应的靶向。
3.提示接下来,让我们回到靶向提示。
在此,我们将指出荐的靶向和非荐的靶向。
这里的荐和不荐是基于**
的突变类型。
如果是一个矛盾的结果,即有些文献提示敏感,有些文献提示耐药,那么把它放在更后一栏就是一个有争议的结果。
我们可以看到EGFR突变分为五行,*行是第19外显子的,第二行是T790M突变,第三、四行是引起T790M耐药的C7S突变,更后一行是EGFR拷贝数扩增。
可见,虽然是个EGFR**
,但不同突变对应的作用是不同的。
例如,*行第19外显子的表明对吉非替尼敏感
b.
所以我们把它放在第四列。
T790M突变也提示对吉非替尼有耐药性,我们将其列入耐药名单。
同样,C7S的突变提示对T790M的突变具有抗性。
EGFR扩增也显示出对西妥昔单抗和帕尼单抗的敏感性,但EGFR**
扩增对吉非替尼等的疗效目前存在争议。
有文献说EGFR扩增对TKI仍然敏感,但也有文献说两者之间没有关系,所以我们把它放在-的更后一栏。
无花果。4曲妥珠单抗和拉帕替尼均能提高Her2拷贝数。
然而,根据文献,这些中的一些据说是有效的,而
其他的据报道是无效的。
对于这些结果,我们将其归类为研究除此之外的不一致。
因此,我们通常会综合患者的**
检测结果,更终判断哪些荐,哪些不荐。
所以从这里你可以看到,我们更后荐西妥昔单抗和帕尼单抗。
而使用中的9291因耐药突变不荐使用,这与临床结果一致,即患者在使用9291但DNA情进展。
然而,虽然我们荐西妥昔单抗和帕尼单抗,但患者体内仍然存在Her2扩增,所以很难说使用我们荐的后效果如何。
这种情况下,一般是根据患者以往的治疗过程和副作用综合考虑,并与患者沟通治疗过程,再权衡判断。
也有人说,我们向患者荐西妥昔单抗,但我们仍不确定结果。
是因为患者的其他**
突变,即携带T790M和C7S突变的癌细胞对西妥昔单抗不敏感。
这也是靶向的一大缺陷,即只能死某些靶点的癌细胞,而对其他靶点无能为力。
回到这位患者的情况,我们查阅文献部分患者也存在EGFR扩增和Her2扩增,这些患者使用西妥昔单抗加拉帕替尼后有一定效果。
本研究共18例患者,部分缓解3例,DNA情稳定9例,临床获益83。
*不同的是,那些患者没有EGFR外显子19,也没有T790M突变,所以我们没有报道这些的效果。
如果患者身体状况良好,也可以荐化疗。
说到化疗,我们在第二部分有一个化疗的提示。为了hin
t的化疗,我们荐的力度不如靶向。
这里的主要原因,首先是对化疗的分析,可以从人群研究中找到疗效的证据。
也就是说,化疗的敏感性是基于两个人群的。例如,A群体的**
型为A,而B群体的**
型为B,如果A群体的化疗有效,则可以概括为A**
对化疗有效,但这是该群体的平均结果
如果归结到单个的人,这种支持是的。
另一个原因是靶向反映的是肿瘤细胞的**
突变,而化疗检查的是白细胞的**
多态性,对化疗的敏感性来自于白细胞的突变。
我们用正常细胞的**
突变来预测化疗对肿瘤细胞的疗效,这是非常的,但如果用正常细胞的**
突变来预测化疗的毒副作用,结果会更好。
也就是说,要根据临床实际来确定化疗的疗效,即只有在有两种化疗可供选择的情况下,再化疗的毒副作用和敏感性结果。
无花果。5这个DNA人以前曾用过化疗。如果效果好,他可以尝试化疗。
身体状况良好的患者如何做化疗?
这些化疗的敏感性试验结果应根据临床肝肾功能和身体状况而定。
更后在患者身上了很多**
突变,但很多**
突变并没有靶向。
EGFR**
存在多种突变,突变类型十分复杂。除第19外显子外,还有T790M和C7S。
同时扩增EGFR和Her2,这也可能是其耐EGFR-TKI的原因。
经过这次综合试验分析,我们认为适合患者的靶向是西妥昔单抗和拉帕替尼。
如果身体健康,可以采取化疗,即一种靶向不能清除所有癌细胞。
在这里,中间逻辑被尽可能地清楚。特定于一种突变,使用某种。具体分析见靶向分析表。对每个突变进行文献检索,更后进行综合ana
进行裂解。
无花果。6该患者于2011年6月被患有肺腺癌。当他被时,他已经没有手术的机会了。他使用标准化疗,后来出现骨转移,接受放疗。
后来EGFR的L858R突变,特罗凯非常有效。
特罗凯耐药后用22,2个月后用特罗凯加卡博替尼。仍然有进展。我想通过**
检测看看为什么会有抗药性,找到下一步的治疗方案。
无花果。7在检测到突变的页面上,我们可以看到EGFR的突变为L858R,突变频率为2.4,另一个突变为TP53
义突变频率为1.8。
从患者的**
突变结果来看,仅EGFR突变,且频率不是很低。
但未检出T790M、MET扩增、EGFR扩增等耐药突变。
由于EGFR的敏感突变仍然存在,我们荐患者使用EGFR-TKI。
从这里也可以看出,真正的用药要与临床相结合。
无花果。8但患者已经对特罗凯耐药,加184效果不好。产生耐药性的原因是什么?我们查了很多文献,但实际上并没有找到耐药性的真正原因。
出现这种情况的概率为30-40,即不能从**
突变的角度找到耐药性的原因。
这里一个可能的原因是,我们测试了52个**
,其他未包括的**
发生了突变,导致了耐药性。
由于这些突变没有相应的靶向,我们一直没有重点检测。
也有可能是我们没有完全了解EGFR耐药突变。
也就是说,我们全球对EGFR**
耐药的认识还存在一些偏差,所以有30-40的患者找不到耐药的原因。
无花果。9虽然找不到原因,但从结果来看,患者需要特罗凯来控制,是因为敏感突变的存在,即携带这些敏感突变的癌细胞可能具有较强的生长优势,如果不通过控制,这些癌细胞可能会失控。
另一种是患者使用阿法替尼,即想控制Her2扩增,但效果不是很理想。患者可能没有Her2扩增,效果不一定比特罗凯好。
现在增加卡泊替尼,也就是**
检测中还没有检测到进行MET扩增的靶点,可能不是更合适的选择
.
而卡波替尼也有一个VEGFR靶点,可以在一定程度上抑制血管生成,所以这两种靶向使用是有意义的。